Es hijo de padre rumano y madre argentina. Su primer libro de ficción, la colección de cuentos Los pájaros (1994), obtuvo el Premio-Beca de la Revista Cultura y fue incluido entre los mejores libros del año por el diario Página/12. A este libro le siguieron dos novelas de importante repercusión: Agua (1997) y La mujer de Wakefield (1999), ambas traducidas a varios idiomas: japonés, inglés, portugués y francés. La versión francesa de esta última fue finalista del Premio Femina, que se entrega en Francia al mejor libro extranjero del año. En 1998, Berti se afincó en París, donde trabajó como periodista cultural y corresponsal para diversos medios argentinos. En el año 2002 publicó de forma simultánea en España y en Argentina los cuentos breves de La vida imposible, cuya traducción al francés recibió el Premio Fernando Aguirre-Libralire, que en ediciones anteriores ganaron Enrique Vila-Matas o Francisco Ayala. En 2004, su novela Todos los Funes quedó finalista del Premio Herralde, y fue considerada por el Times Literary Supplement uno de los mejores libros del año. También cabe destacar sus novelas La sombra del púgil (2008), La máquina de escribir caracteres chinos (2017), Una presencia ideal (2018) y sus últimos libros de cuentos: Lo inolvidable (2010) y Círculo de lectores (2020). A finales de 2011, Eduardo Berti obtuvo en Argentina el Premio Emecé, en fallo unánime, por su novela El país imaginado, que Impedimenta recuperó en 2012 para el resto de los lectores hispanohablantes y que también se alzó con el Premio Casa de las Américas de novela. Impedimenta asimismo ha publicado Un padre extranjero (2016), precuela de Un hijo extranjero (2022); su colaboración con el colectivo Monobloque, Inventario de inventos (inventados) (2017), y Faster (2019). Berti vive actualmente en Francia y es miembro desde 2014 de Oulipo (Taller de literatura potencial), fundado por Raymond Queneau y François Le Lionnais.